DNA片段制備
NGS樣品庫(kù)制備
CHIP片段制備
細(xì)胞亞結(jié)構(gòu)提取
聯(lián)系人：文女士
電話：0755-26410427
郵箱：equipment@dakewe.com
原理：
Digital Adaptive Sonocavitation（DAS）技術(shù)即“數(shù)字式自適應(yīng)超聲空化”技術(shù)，是指通過壓電轉(zhuǎn)換器，將數(shù)字式電信號(hào)，轉(zhuǎn)變?yōu)楦哳l聲波信號(hào)，產(chǎn)生數(shù)百萬(wàn)的水分子“空穴”，在幾微秒內(nèi)“空穴”變大、破碎產(chǎn)生扭曲物理力打斷生物大分子。
技術(shù)對(duì)比：
1）EpiSonic? 1100采用淺盤式水槽，底盤超聲發(fā)生器大，超聲波基本呈直線往上達(dá)到樣本，樣本受超聲機(jī)械能均一，能量損失少，能承載1-96個(gè)樣本
2）Competitor D 深桶式水槽設(shè)計(jì)，超聲機(jī)械能Breitling Superocean Replica Replica Hublot Large Bang Depeche Mode Replica Montblanc Nicolas Rieusse Panerai Ferrari Replica Watches 通過直線或者桶壁反射到達(dá)樣本，能量損失多，受力均一性差，承載小樣本數(shù)有限（最多12個(gè)）
3）Competitor C 高頻聚焦超聲技術(shù)，采用特制的聚焦式超聲發(fā)生器，聚焦點(diǎn)只有一個(gè)，采用特制的樣品管，昂貴而且一次只能放一個(gè)；另外瞬間能量非常高，導(dǎo)致樣品升溫非常嚴(yán)重
溫控：
在超聲破碎的過程中，對(duì)樣品的溫度控制，是防止樣品過熱，得到高重復(fù)性、高一致性結(jié)果的關(guān)鍵措施。
1） 采用直線式超聲淺盤設(shè)計(jì)，EpiSonic? 1100每個(gè)樣品管承載的能量為0.1W（低于其他產(chǎn)品的承載能量）
2）采用循環(huán)水冷卻系統(tǒng)，通過冷卻裝置將樣品槽內(nèi)多余熱量，
迅速由外周水槽流走，同時(shí)淺盤設(shè)計(jì)比深桶設(shè)計(jì)利于冷水循環(huán)
3）采用DASTM技術(shù)，外周水槽中的水處于急速湍流狀態(tài)，利于熱量從樣品傳導(dǎo)到外周水槽
應(yīng)用：
1、為DNA測(cè)序、CHIP提供優(yōu)質(zhì)的文庫(kù)：
EpiSonic? 1100為DNA測(cè)序、ChIP精準(zhǔn)提供所需大小的片段，具有高樣品得率、重復(fù)性和一致性，可自動(dòng)地、按預(yù)定程序快速處理96孔PCR板或標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)管。
2、可與多種NGS分析平臺(tái)兼容：
EpiSonic? 1100可以將2000bp以下的DNA剪切成高質(zhì)量的、含有下一代測(cè)序
所需的DNA文庫(kù)的片段，可與多種NGS分析平臺(tái)兼容：lllumina Genome Analyzer，
lllumina Hiseq，lllumina Miseq，Roche 454 Sequencing GS FLX，Roche 454
Sequencing GS Junior，Life Technologies SOLiD System，Life Technologies Ion Torrent等
3、可與多種ChIP分析
平臺(tái)兼容：
EpiSonic? 1100是一款最理想的設(shè)備，可產(chǎn)生用于ChIP的200-600bp的片段，可與多種ChIP分析平臺(tái)兼容：ChIP-PCR/qPCR，ChIP-chip，ChIP-Seq等。
4、精確性高、一致性好、重復(fù)性好：
DNA在不同超聲持續(xù)時(shí)間內(nèi)被精確剪切成不同大小的片段；將同一細(xì)胞的不同樣本并行處理后，所得到的剪切片段大小基本一致；相同的樣品分批處理后，所得到的平均片段大小基本相同
A B A B
Fig.1 Fig.2
Fig.1 Demonstration of precise DNA shearing of different sizes.3μg of placental DNA in 0.2 ml tubes were sheared with the EpiSonicTM 1100 at different sonication durations(10,15,20,45,and 62.5 min).The resulting lengths of the sheared DNA were analyzed with an Agilent Bioanalyzer 2100 [A] and an agarose gel [B].
Fig.2 Demonstration of Sample-to-Sample Consistency.2μg of placental DNA in 30μl buffer were placed in well positions B2,B6,D6,E7,F9,and G11 of a 96-well PCR plate and sheared with the EpiSonicTM 1100 for 40 cycles [A] and then repeated in a subsequent run with the exact same conditions [B].
Fig.3 Demonstration of high reproducibility. 3μg sample of placental DNA (30μl ) in the different wells of a 96-well plate was sheared with the EpiSonicTM 1100 for 40 cycles.The resulting lengths of the sheared DNA were analyzed with an Agilent Bioanalyzer 2100. Average sheared DNA size is 380.4 bps for the first run [A] and is 379.2bps for the next run [B].The two Bioanalyzer imagas were then overlapped to visualize the high reproducibility [C]. The CV% of sample to sample in the same run is 1.1 to 4.7% and is 0.3% between the different runs .Average percentage of dsDNA recovered from 10 samples is 75.2%.
設(shè)備介紹：
EpiSonic? 1100系統(tǒng)主要包括三個(gè)部分：超聲波發(fā)生器、冷卻系統(tǒng)、樣品臺(tái)。
超聲波發(fā)生器 樣品臺(tái) 循環(huán)水冷卻系統(tǒng)
超聲波發(fā)生器
通過操作 超聲波發(fā)生器控制面板，將電信號(hào)通過超聲波轉(zhuǎn)換器轉(zhuǎn)換成聲波信號(hào)，傳入樣品室，
破碎樣品，該部分具有以下優(yōu)點(diǎn)：
觸屏控制：簡(jiǎn)單、直觀的菜單導(dǎo)航
高精確度：數(shù)字式調(diào)整所有的設(shè)置
實(shí)時(shí)能量、溫度監(jiān)測(cè)：儀器屏幕可顯示振幅、瓦特、焦耳讀數(shù)及樣品槽內(nèi)的溫度等
自動(dòng)超載保護(hù)：監(jiān)測(cè)故障，出現(xiàn)故障時(shí)可關(guān)閉系統(tǒng) 以防止損壞電路
可編程序存儲(chǔ)器：可儲(chǔ)存10個(gè)程序，按屏幕的數(shù)字鍵即可選擇、調(diào)用相應(yīng)程序
樣品臺(tái)
可放置標(biāo)準(zhǔn)0.2ml PCR管、半裙管或者96孔PCR板、1.5ml的樣品管
密閉容器處理：密閉的管/孔的非接觸超聲波處理，可以防止樣品污染和降解
生物安全性：沒有氣霧產(chǎn)生，不用繁瑣的操作探針，提高了安全性
循環(huán)水冷卻系統(tǒng)
通過冷卻器將樣品室內(nèi)多余熱量，通過輸水管迅速由外周水槽流走
產(chǎn)品參數(shù)：
